一、问题分析
开始系统上是默认的IE6，部分https能打开，部分打不开，提示的IE默认的DNS错误页面
升级IE8后情况一样，尝试过S5代理还是一样，所以可以判断不是IE和目标网站的问题了
Google了一下，有人提到是WIN2K3下IE不支持SHA2加密的SSL问题，导了个证书看了下果然是SHA2，能打开的几个网站是SHA1

二、微软官网给了解决方案
安装KB 938397来支持SHA-2，重启生效，kb938397介绍 , 下载地址

三、参考资料
http://superuser.com/questions/132940/windows-2003-server-cant-connect-to-an-ssl-site-from-ie
http://zh.wikipedia.org/wiki/SHA%E5%AE%B6%E6%97%8F